مرکز کنترل ترافیک دریایی، مسئولیت ارتباط و هماهنگی های لازم جهت انجام عملیات دریایی اعم از هماهنگی با کشتی ها جهت پهلودهی، جداسازی، لنگر اندازی، اعزام راهنما ، یدک کش، بارج، ملوان اسکله و.. را بر عهده دارد .
عمده فعالیت های مرکز کنترل بندر چابهار به شرح زیر می باشد.
1) انجام کشیک 24 ساعته برروی کانال 13 و 16 VHF
2) دریافت پیام های اضطرار از قبیل آتش سوزی، تصادفات، حوادث و آلودگی و... برروی سیستم VHF-DSC این دریافت بصورت تلفنی – فکس – رادیو تلفنی ( باند دریایی) از طرف مراکز و شناورهای عبوری است
3) دریافت درخواست مربوط به ورود و خروج شناورها از سوی نمایندگی کشتیرانی، ثبت آنها در سیستم جامع دریایی و اعلام به اداره امور دریایی و امور بندری
4) انجام امور هماهنگی برای شناور های ورودی و خروجی و نیز کنترل کلیه مراحل پهلودهی ، جداسازی و یا جابجایی و ثبت اطلاعات مربوط به کشتی ها
5) برنامه ریزی، نظارت و پیگیری مستمر حرکت کلیه واحدهای شناوری در محدوده دید راداری و چشمی اعم از درحال حرکت یا در لنگر.
6) هماهنگی جهت ارائه خدمات درخواستی شناورها با واحدهای خدمات دریایی از قبیل سوخت، آب، دریافت زباله، مواد زائد نفتی و غیره